高速匀浆机匀浆的方式有多种：手工匀浆、机器匀浆、超声匀浆、反复冻融。

　　高速匀浆机手工匀浆：将剪碎的组织倒入玻璃匀浆管中，再将剩余的1/3匀浆介质或生理盐水冲洗残留在烧杯中的碎组织块，一起倒入匀浆管中进行匀浆，左手持匀浆管将下端插入盛有冰水混合物的器皿中，右手将捣杆垂直插入套管中，上下转动研磨数十次（6～8分钟），充分研碎，使组织匀浆化。

　　高速匀浆机机器匀浆：用组织研磨机（OMNIBead Ruptor 24 多样品研磨珠均质仪） 6m/s研磨制成10％组织匀浆，也可用内切式组织匀浆机制备(Omni Prep 多样品均质仪 )匀浆时间20秒/次，间隙10秒，连续3-5次。

　　超声粉碎：用超声波细胞破碎仪(OMNI Sonic Ruptor400W)进行破碎，高速匀浆机可用以振幅12.7mm超声处理30秒使细胞破碎.

　　反复冻融：培养或者分离的细胞可以用以上的方法匀浆，也可以反复冻溶3次左右（即让细胞加适量的低渗液或者双蒸水放低温冰箱中结冰，溶解，再结冰，再溶解，反复3次左右），但有部分酶活力会受影响。

　　取少量组织匀浆做涂片（直接涂片、染色均可），显微镜下观察细胞是否磨破，若没有破则可以延长匀浆时间或增加冻融次数。

　　4、将制备好的10％匀浆用普通高速匀浆机或低温低速匀浆机3000r/min左右离心10～15分钟，若检测ATP酶，则只需要1000转/分，离心5分钟，将离心好的匀浆留下上清弃下面沉淀。

　　高速匀浆机又名，多样品组织研磨机，快速组织研磨机，多样品组织匀浆机，快速样品匀浆系统,快速核酸提取仪/多功能型均质器，系统与目前已有的其它样品制备方法相比，具有通用性广、灵活的优 点。高速匀浆机系统避免了研磨、匀浆、超声波处理等传统方法的费力、耗时、低效等诸多缺点，高速匀浆机可以、快速、稳定地裂解并纯化各种类型样品的核酸与蛋白。